Nem meglepő, hogy a kifinomult emésztési folyamatokat lehetővé tevő érzékeny bélrendszer igen fogékony a megbetegedésekre. Ezeket okozhatják baktériumok, például Escherichia coli, vírusok, vagy paraziták. Az emésztőrendszer megbetegedésének leggyakoribb jelentkező tünete a hasmenés, ami súlyosabb esetben-ha a bél nyálkahártyája is megsérül-véres is lehet. A hasmenés bármilyen korú állaton kialakulhat, de a fiatal nyulak valamivel érzékenyebbek rá, mint a felnőtt állatok.  Ilyenkor azonnal keressük fel az állatorvost, aki elsőként valószínűleg folyadékterápiát fog javasolni. Ez megvédi a belső szerveket a kiszáradástól, és ha valamilyen gyógyszerrel-például loperamiddal-is kiegészítik, megállítja a hasmenést. Antibiotikumot csak legsúlyosabb esetekben írnak fel, hiszen ezek a hasmenéseknek csak  bizonyos okait tudják megszüntetni, más esetekben még súlyosbíthatják is a beteg állapotát. A hasmenésben szenvedő nyuszi étvágyát megpróbálhatjuk a saját gabonapehely-reggelinkkel helyrehozni, amit vízben áztatunk, hogy megpuhuljon. Ha meggyógyult természetesen visszatérhet régi étrendjéhez.

Coccidiosis

Cysticercosis

Emésztési rendellenességek